自 2020 年以来，个人股权转让信息自动交互机制已逐渐在全国推广落地，除上海外，北京、天津、海南、广东、四川、重庆等全国多个省市均陆续出台了个人股权转让“先完税，后变更”的相关规定。

诸多《通告》均提出：个人转让股权办理股东变更登记的，在向市场监督管理部门办理变更登记前，扣缴义务人、纳税人应依法在被投资企业所在地主管税务机关办理纳税申报。

1.“个人转让股权”中的“个人”指的是自然人股东

《通告》提出，根据《中华人民共和国个人所得税法》和相关税收征管规定，市场监督管理局对个人转让股权个人所得税实施联合管理，个人的股权或股份是指自然人股东的股权或股份。

因此，如果转让方不是自然人股东，则不适用于此处的规定。

2.个人转让的“企业”不包括个人独资企业和合伙企业

根据国家税务总局 67 号文规定，被投资企业是指在中国境内成立的企业或组织，不包括个人独资企业和合伙企业。

3.纳税申报地点为“被投资企业所在地”主管税务机关

《通告》指出，办理纳税申报的地点应该在「被投资企业所在地」的主管税务机关，“个人股权转让所得个人所得税以被投资企业所在地税务机关为主管税务关。”

因此，个人转让股权所得申报纳税的地点，不是在股权转让人的住所或经常居住地，也不是股权受让方的所在地，而是在被投资企业所在地税务部门申报。

另外，如果股权受让人所在地和被投资企业所在地不是同一纳税地，在办理股权转让个人所得税之前，受让人还需提前在被投资企业所在地办理扣缴义务人登记。

很多公司都会设立专门的有限合伙企业作为员工持股平台，员工只是间接持有公司股权。如果通过间接持股的方式转让公司股权，该如何纳税呢？

目前各地税务主管机关通常采用以下两种路径：

方式一：比照个体工商户，按经营所得申报纳税

我国对个人独资企业和合伙企业不征收企业所得税，其投资者的生产经营所得，比照个体工商户的生产、经营所得征收个人所得税。转让财产收入属于个体工商户的生产经营收入，应适用 5%~35% 的五级累进税率。

方式二：按照财产转让所得申报纳税

根据国家税务总局 67 号文第四条规定，个人转让股权以股权转让收入减去股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按“财产转让所得”缴纳个税，税率为 20%。

而我国《民法典》个体工商户的定义规定在第三章自然人，也应按照自然人股权转让所得按 20% 计征个人所得税。

但根据税务总局和各地税务机关陆续出台的指导意见，有限合伙企业将转让股权所得分配给员工并按照 20% 计征个人所得税的情况被认为是违反了相关规定，多地已要求应按照个体工商户生产经营所得，适用 5%~35% 的五级累进税率进行缴纳。

小二建议，企业通过持股平台转让员工股权前，应咨询了解当地税收管理规定，避免操作不当受到税务机关的行政处罚。